Xavier Biarnés Fontal

2024

Comparison of two peroxidases with high potential for biotechnology applications – HRP vs. APEX2

Škulj, S., Kožić, M., Barišić, A., Vega, A., Biarnés, X., Piantanida, I., Barisic, I. & Bertoša, B., de des. 2024, In: Computational and Structural Biotechnology Journal. 23, pàg. 742-751 10 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

Accés Obert

1 Citació (Scopus)

Expanding the chitin oligosaccharide portfolio by engineering NodC chitin synthases in Escherichia coli

Guidi, C., Biarnés, X., Planas, A. & De Mey, M., de gen. 2024, In: Current Research in Biotechnology. 8, 12 pàg., 100255.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

Accés Obert

Unravelling the Antifibrinolytic Mechanism of Action of the 1,2,3-Triazole Derivatives

Rabadà, Y., Bosch-Sanz, O., Biarnés, X., Pedreño, J., Caveda, L., Sánchez-García, D., Martorell, J. & Balcells, M., de jul. 2024, In: International Journal of Molecular Sciences. 25, 13, 18 pàg., 7002.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

Accés Obert

2023

Binding of common organic UV-filters to the thyroid hormone transport protein transthyretin using in vitro and in silico studies: Potential implications in health.

Cotrina, E. Y., Oliveira, Â., Llop, J., Quintana, J., Biarnés, X., Cardoso, I., Díaz-Cruz, M. S. & Arsequell, G., 15 de gen. 2023, In: Environmental Research. 217, 11 pàg., 114836.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

Accés Obert

8 Cites (Scopus)

Controlled processivity in glycosyltransferases: A way to expand the enzymatic toolbox

Guidi, C., Biarnés, X., Planas, A. & De Mey, M., 1 de març 2023, In: Biotechnology Advances. 63, 16 pàg., 108081.

Producció científica: Article en revista indexada › Article de revisió (sistemàtica) › Avaluat per experts

7 Cites (Scopus)

Control of Substrate Conformation by Hydrogen Bonding in a Retaining β-Endoglycosidase

Nin-Hill, A., Ardevol, A., Biarnés, X., Planas, A. & Rovira, C., 14 de des. 2023, In: Chemistry - A European Journal. 29, 70, 8 pàg., e202302555.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

Accés Obert

2022

1,2,3-Triazole Derivatives as Novel Antifibrinolytic Drugs

Bosch-Sanz, O., Rabadà, Y., Biarnés, X., Pedreño, J., Caveda, L., Balcells, M., Martorell, J. & Sánchez-García, D., de des. 2022, In: International Journal of Molecular Sciences. 23, 23, 14942.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

Accés Obert

2 Cites (Scopus)

Enzymatic Hydrolysis of Human Milk Oligosaccharides. The Molecular Mechanism of Bifidobacterium Bifidum Lacto- N-biosidase

Cuxart, I., Coines, J., Esquivias, O., Faijes, M., Planas, A., Biarnés, X. & Rovira, C., 15 d’abr. 2022, In: ACS Catalysis. 12, 8, pàg. 4737-4743 7 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

Accés Obert

10 Cites (Scopus)

Integrative structure determination reveals functional global flexibility for an ultra-multimodular arabinanase

Lansky, S., Salama, R., Biarnés, X., Shwartstein, O., Schneidman-Duhovny, D., Planas, A., Shoham, Y. & Shoham, G., de des. 2022, In: Communications Biology. 5, 1, 14 pàg., 465.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

Accés Obert

3 Cites (Scopus)

2019

Essential Mycoplasma Glycolipid Synthase Adheres to the Cell Membrane by Means of an Amphipathic Helix

Romero-García, J., Biarnés, X. & Planas, A., 1 de des. 2019, In: Scientific Reports. 9, 1, 11 pàg., 7085.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

Accés Obert

5 Cites (Scopus)

Structure-function relationships underlying the dual N-acetylmuramic and N-acetylglucosamine specificities of the bacterial peptidoglycan deacetylase PdaC

Grifoll-Romero, L., Sainz-Polo, M. A., Albesa-Jové, D., Guerin, M. E., Biarnés, X. & Planas, A., 13 de des. 2019, In: Journal of Biological Chemistry. 294, 50, pàg. 19066-19080 15 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

Accés Obert

17 Cites (Scopus)

2018

Chitin deacetylases: Structures, specificities, and biotech applications

Grifoll-Romero, L., Pascual, S., Aragunde, H., Biarnés, X. & Planas, A., 22 de març 2018, In: Polymers. 10, 4, 29 pàg., 352.

Producció científica: Article en revista indexada › Article de revisió (sistemàtica) › Avaluat per experts

Accés Obert

106 Cites (Scopus)

Enginyeria de quitinases de la família GH18 per a l’obtenció de polímers de quitosà amb seqüències definides

Alsina, C., Aranda-Martínez, A., Sancho-Vaello, E., Biarnés, X., Faijes, M. & Planas, A., 1 de nov. 2018, In: Revista de la Societat Catalana de Química. 17, pàg. 32-44 13 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Article

Accés Obert

Expression and specificity of a chitin deacetylase from the nematophagous fungus Pochonia chlamydosporia potentially involved in pathogenicity

Aranda-Martinez, A., Grifoll-Romero, L., Aragunde, H., Sancho-Vaello, E., Biarnés, X., Lopez-Llorca, L. V. & Planas, A., 1 de des. 2018, In: Scientific Reports. 8, 1, 12 pàg., 2170.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

Accés Obert

23 Cites (Scopus)

Oxazoline or Oxazolinium Ion? The Protonation State and Conformation of the Reaction Intermediate of Chitinase Enzymes Revisited

Coines, J., Alfonso-Prieto, M., Biarnés, X., Planas, A. & Rovira, C., 20 de des. 2018, In: Chemistry - A European Journal. 24, 72, pàg. 19258-19265 8 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

25 Cites (Scopus)

Substrate recognition and specificity of chitin deacetylases and related family 4 carbohydrate esterases

Aragunde, H., Biarnés, X. & Planas, A., de febr. 2018, In: International Journal of Molecular Sciences. 19, 2, 30 pàg., 412.

Producció científica: Article en revista indexada › Article de revisió (sistemàtica) › Avaluat per experts

Accés Obert

58 Cites (Scopus)

2017

Predicting amino acid substitution probabilities using single nucleotide polymorphisms

Rizzato, F., Rodriguez, A., Biarnés, X. & Laio, A., d’oct. 2017, In: Genetics. 207, 2, pàg. 643-652 10 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

2 Cites (Scopus)

Structural Snapshots and Loop Dynamics along the Catalytic Cycle of Glycosyltransferase GpgS

Albesa-Jové, D., Romero-García, J., Sancho-Vaello, E., Contreras, F. X., Rodrigo-Unzueta, A., Comino, N., Carreras-González, A., Arrasate, P., Urresti, S., Biarnés, X., Planas, A. & Guerin, M. E., 5 de jul. 2017, In: Structure. 25, 7, pàg. 1034-1044.e3 14 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

Accés Obert

14 Cites (Scopus)

2016

A single point mutation alters the Transglycosylation/Hydrolysis partition, significantly enhancing the synthetic capability of an endo-Glycoceramidase

Durand, J., Biarnes, X., Watterlot, L., Bonzom, C., Borsenberger, V., Planas, A., Bozonnet, S., O’Donohue, M. J. & Faure, R., 2 de des. 2016, In: ACS Catalysis. 6, 12, pàg. 8264-8275 12 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

17 Cites (Scopus)

2015

A Native Ternary Complex Trapped in a Crystal Reveals the Catalytic Mechanism of a Retaining Glycosyltransferase

Albesa-Jové, D., Mendoza, F., Rodrigo-Unzueta, A., Gomollõn-Bel, F., Cifuente, J. O., Urresti, S., Comino, N., Gõmez, H., Romero-García, J., Lluch, J. M., Sancho-Vaello, E., Biarnés, X., Planas, A., Merino, P., Masgrau, L. & Guerin, M. E., 1 d’ag. 2015, In: Angewandte Chemie - International Edition. 54, 34, pàg. 9898-9902 5 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

35 Cites (Scopus)

Enzymatic production of defined chitosan oligomers with a specific pattern of acetylation using a combination of chitin oligosaccharide deacetylases

Hamer, S. N., Cord-Landwehr, S., Biarnés, X., Planas, A., Waegeman, H., Moerschbacher, B. M. & Kolkenbrock, S., 2015, In: Scientific Reports. 5, 9 pàg., 8716.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

Accés Obert

110 Cites (Scopus)

Molecular design of non-leloir furanose-transferring enzymes from an alpha-L-arabinofuranosidase: A rationale for the engineering of evolved transglycosylases

Bissaro, B., Durand, J., Biarnés, X., Planas, A., Monsan, P., O'Donohue, M. J. & Fauré, R., d’ag. 2015, In: ACS Catalysis. 5, 8, pàg. 4598-4611 14 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

34 Cites (Scopus)

Structural-functional analysis reveals a specific domain organization in family GH20 hexosaminidases

Val-Cid, C., Biarnés, X., Faijes, M. & Planas, A., 29 de maig 2015, In: PLoS ONE. 10, 5, 17 pàg., e0128075.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

Accés Obert

14 Cites (Scopus)

2014

A transitional hydrolase to glycosynthase mutant by Glu to Asp substitution at the catalytic nucleophile in a retaining glycosidase

Aragunde, H., Castilla, E., Biarnés, X., Faijes, M. & Planas, A., 7 de maig 2014, In: Carbohydrate Research. 389, 1, pàg. 85-92 8 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

5 Cites (Scopus)

Next generation sequencing in nonsyndromic intellectual disability: From a negative molecular karyotype to a possible causative mutation detection

Athanasakis, E., Licastro, D., Faletra, F., Fabretto, A., Dipresa, S., Vozzi, D., Morgan, A., D'Adamo, A. P., Pecile, V., Biarnés, X. & Gasparini, P., de gen. 2014, In: American Journal of Medical Genetics, Part A. 164, 1, pàg. 170-176 7 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

36 Cites (Scopus)

Structural basis of chitin oligosaccharide deacetylation

Andrés, E., Albesa-Jové, D., Biarnés, X., Moerschbacher, B. M., Guerin, M. E. & Planas, A., 1 de jul. 2014, In: Angewandte Chemie - International Edition. 53, 27, pàg. 6882-6887 6 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

80 Cites (Scopus)

Structural determinants in prion protein folding and stability

Benetti, F., Biarnés, X., Attanasio, F., Giachin, G., Rizzarelli, E. & Legname, G., 11 de nov. 2014, In: Journal of Molecular Biology. 426, 22, pàg. 3796-3810 15 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

27 Cites (Scopus)

2013

Congenital hyperinsulinism: Clinical and molecular analysis of a large Italian cohort

Faletra, F., Athanasakis, E., Morgan, A., Biarnés, X., Fornasier, F., Parini, R., Furlan, F., Boiani, A., Maiorana, A., Dionisi-Vici, C., Giordano, L., Burlina, A., Ventura, A. & Gasparini, P., 25 de maig 2013, In: Gene. 521, 1, pàg. 160-165 6 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

23 Cites (Scopus)

Nucleation process of a fibril precursor in the C-terminal segment of amyloid-beta

Baftizadeh, F., Pietrucci, F., Biarnés, X. & Laio, A., 17 d’abr. 2013, In: Physical Review Letters. 110, 16, 5 pàg., 168103.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

50 Cites (Scopus)

Structure-function features of a mycoplasma glycolipid synthase derived from structural data integration, molecular simulations, and mutational analysis

Romero-García, J., Francisco, C., Biarnés, X. & Planas, A., 3 de des. 2013, In: PLoS ONE. 8, 12, 14 pàg., e81990.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

Accés Obert

10 Cites (Scopus)

2012

Bacterial glycoglycerolipid synthases: Processive and non-processive glycosyltransferases in mycoplasma

Andrés, E., Biarnés, X., Faijes, M. & Planas, A., de maig 2012, In: Biocatalysis and Biotransformation. 30, 3, pàg. 274-287 14 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Article de revisió (sistemàtica) › Avaluat per experts

9 Cites (Scopus)

Identification of a new mutation (L46P) in the human NOG gene in an Italian patient with Symphalangism syndrome

Athanasakis, E., Biarnés, X., Bonati, M. T., Gasparini, P. & Faletra, F., de juny 2012, In: Molecular Syndromology. 3, 1, pàg. 21-24 4 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

Accés Obert

6 Cites (Scopus)

METAGUI. A VMD interface for analyzing metadynamics and molecular dynamics simulations

Biarnés, X., Pietrucci, F., Marinelli, F. & Laio, A., de gen. 2012, In: Computer Physics Communications. 183, 1, pàg. 203-211 9 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

81 Cites (Scopus)

Multidimensional view of amyloid fibril nucleation in atomistic detail

Baftizadeh, F., Biarnes, X., Pietrucci, F., Affinito, F. & Laio, A., 29 de febr. 2012, In: Journal of the American Chemical Society. 134, 8, pàg. 3886-3894 9 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

75 Cites (Scopus)

2011

Catalytic itinerary in 1,3-1,4-beta-glucanase unraveled by QM/MM metadynamics. Charge is not yet fully developed at the oxocarbenium ion-like transition state

Biarnés, X., Ardèvol, A., Iglesias-Fernández, J., Planas, A. & Rovira, C., 21 de des. 2011, In: Journal of the American Chemical Society. 133, 50, pàg. 20301-20309 9 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

79 Cites (Scopus)

Molecular motions in drug design: The coming age of the metadynamics method

Biarnés, X., Bongarzone, S., Vargiu, A. V., Carloni, P. & Ruggerone, P., de maig 2011, In: Journal of Computer-Aided Molecular Design. 25, 5, pàg. 395-402 8 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

37 Cites (Scopus)

2010

Discovery of a class of diketopiperazines as antiprion compounds

Bolognesi, M. L., Tran, H. N. A., Staderini, M., Monaco, A., López-Cobẽas, A., Bongarzone, S., Biarnés, X., López-Alvarado, P., Cabezas, N., Caramelli, M., Carloni, P., Menéndez, J. C. & Legname, G., 2 d’ag. 2010, In: ChemMedChem. 5, 8, pàg. 1324-1334 11 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

45 Cites (Scopus)

Discovery of a class of diketopiperazines as antiprion compounds (ChemMedChem (2010), 8 (1324))

Bolognesi, M. L., Ai Tran, H. N., Staderini, M., Monaco, A., López-Cobeñas, A., Bongarzone, S., Biarnés, X., López-Alvarado, P., Cabezas, N., Caramelli, M., Carloni, P., Menéndez, J. C. & Legname, G., 3 de set. 2010, In: ChemMedChem. 5, 9, pàg. 1414 1 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Comentari/debat

Accés Obert

Insights into the binding of phenyltiocarbamide (PTC) agonist to its target human TAS2R38 bitter receptor

Biarnés, X., Marchiori, A., Giorgetti, A., Lanzara, C., Gasparini, P., Carloni, P., Born, S., Brockhoff, A., Behrens, M. & Meyerhof, W., 2010, In: PLoS ONE. 5, 8, 6 pàg., e12394.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

Accés Obert

94 Cites (Scopus)

Reductive cleavage mechanism of Co - C bond in cobalamin-dependent methionine synthase

Alfonso-Prieto, M., Biarnés, X., Kumar, M., Rovira, C. & Kozlowski, P. M., 14 d’oct. 2010, In: Journal of Physical Chemistry B. 114, 40, pàg. 12965-12971 7 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

30 Cites (Scopus)

The conformational free-energy landscape of beta-D-mannopyranose: evidence for a S-1(5) -> B-2,B-5 -> S-O(2) catalytic itinerary in beta-mannosidases

Ardèvol, A., Biarnés, X., Planas, A. & Rovira, C., 17 de nov. 2010, In: Journal of the American Chemical Society. 132, 45, pàg. 16058-16065 8 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

43 Cites (Scopus)

2009

Docking ligands on protein surfaces: The case study of prion protein

Kranjc, A., Bongarzone, S., Rossetti, G., Biarnés, X., Cavalli, A., Bolognesi, M. L., Roberti, M., Legname, G. & Carloni, P., de set. 2009, In: Journal of Chemical Theory and Computation. 5, 9, pàg. 2565-2573 9 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

33 Cites (Scopus)

The molecular mechanism of the catalase reaction

Alfonso-Prieto, M., Biarnés, X., Vidossich, P. & Rovira, C., 26 d’ag. 2009, In: Journal of the American Chemical Society. 131, 33, pàg. 11751-11761 11 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

345 Cites (Scopus)

2008

Density-functional molecular dynamics studies of biologically relevant iron and cobalt complexes with macrocyclic ligands

Degtyarenko, I., Biarnés, X., Nieminen, R. M. & Rovira, C., de jul. 2008, In: Coordination Chemistry Reviews. 252, 12-14, pàg. 1497-1513 17 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Article de revisió (sistemàtica) › Avaluat per experts

11 Cites (Scopus)

2007

The conformational free energy landscape of β-D-glucopyranose. Implications for substrate preactivation in β-glucoside hydrolases

Biarnés, X., Ardèvol, A., Planas, A., Rovira, C., Laio, A. & Parrinello, M., 5 de set. 2007, In: Journal of the American Chemical Society. 129, 35, pàg. 10686-10693 8 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

195 Cites (Scopus)

2006

A first principles study of the binding of formic acid in catalase complementing high resolution X-ray structures

Rovira, C., Alfonso-Prieto, M., Biarnés, X., Carpena, X., Fita, I. & Loewen, P. C., 31 de març 2006, In: Chemical Physics. 323, 1, pàg. 129-137 9 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

10 Cites (Scopus)

Substrate distortion in the michaelis complex of Bacillus 1,3-1,4-β-glucanase: Insight from first principles molecular dynamics simulations

Biarnés, X., Nieto, J., Planas, A. & Rovira, C., 20 de gen. 2006, In: Journal of Biological Chemistry. 281, 3, pàg. 1432-1441 10 pàg.

Producció científica: Article en revista indexada › Article › Avaluat per experts

Accés Obert

84 Cites (Scopus)

Xavier Biarnés Fontal

Producció científica

Resultats de la cerca